Constant area plugin done -- fix

Samo Penic

2019-03-08 06f70cc6f065746cf79c9792228356e3f015f4ec

 src/general.h

@@ -252,6 +252,11 @@
typedef struct ts_poly_list ts_poly_list;


typedef struct{
   ts_float z_max;
   ts_float z_min;
   ts_int force_switch;
} ts_confinement_plane;

typedef struct {
   long int nshell;
@@ -293,9 +298,68 @@
   ts_double c0;
   ts_double w;
   ts_double F;
   long int plane_confinement_switch;
   ts_double plane_d;
   ts_double plane_F;
} ts_tape;


/* plugins */
typedef struct {
   void (*at_start)(int argc, char **argv);
   void *(*after_vesicle_init)(void *vesicle);
   ts_bool (*vm_hard_constraint)(void *vesicle, ts_vertex *vtx, ts_vertex *odl_vtx);
   void (*vm_energy_before_prepare)(void *vesicle, ts_vertex *vtx);
   ts_double (*vm_energy_before_execute)(void *vesicle, ts_vertex *vtx);
   ts_double (*vm_energy_after_prepare)(void *vesicle, ts_vertex *vtx);
   ts_double (*vm_energy_after_execute)(void *vesicle, ts_vertex *vtx);
   ts_double (*vm_before_montecarlo_constraint)(void *vesicle, ts_vertex *vtx, ts_vertex *old_vtx);
   ts_double (*vm_new_state_accepted)(void *vesicle, ts_vertex *vtx, ts_vertex *old_vtx);
   ts_double (*vm_new_state_rejected)(void *vesicle, ts_vertex *vtx, ts_vertex *old_vtx);
   void (*cleanup)(void);
} ts_plugin_function;

typedef struct {
   ts_char *name;
   ts_char *description;
   ts_char *author;
   void *data;
} ts_plugin_details;

typedef struct {
   ts_plugin_details *details;
   ts_plugin_function *function;
   ts_char *filename;
   void *libhandle;
} ts_plugin;

struct ts_plugin_chain {
   ts_plugin *plugin;
   struct ts_plugin_chain *next;
};
typedef struct ts_plugin_chain ts_plugin_chain;

typedef struct {
   ts_plugin_chain *at_start;
   ts_plugin_chain *after_vesicle_init;
   ts_plugin_chain *vm_hard_constraint;
   ts_plugin_chain *vm_energy_before_prepare;
   ts_plugin_chain *vm_energy_after_execute;
   ts_plugin_chain *vm_before_montecarlo_constraint;
   ts_plugin_chain *vm_new_state_accepted;
   ts_plugin_chain *vm_new_state_rejected;
   ts_plugin_chain *cleanup;
} ts_plugin_chains;


typedef struct {
   ts_uint n;
   ts_plugin **plugin;
   ts_plugin_chains *chain;
   ts_plugin_chain *pointer;
} ts_plugin_list;

/* end plugins */


typedef struct {
@@ -318,13 +382,15 @@
   ts_double spring_constant;
   ts_double pressure;
   ts_int pswitch;
    ts_tape *tape;
    ts_tape *tape;
   ts_double R_nucleus;
   ts_double R_nucleusX;
   ts_double R_nucleusY;
   ts_double R_nucleusZ;
   ts_double nucleus_center[3];
    ts_double area;
   ts_double area;
   ts_confinement_plane confinement_plane;
   ts_plugin_list *plist;
} ts_vesicle;