Trisurf Monte Carlo simulator
Samo Penic
2013-11-24 84af719f37b54185ddd7daf0627421143874905c
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
####### Vesicle definitions ###########
# nshell is a number of divisions of dipyramid
nshell=17
# dmax is the square of the bond length 
dmax=1.67
# bending rigidity of the membrane 
xk0=25.0
# max step size 
stepsize=0.15
 
 
#######  Cell definitions ############
nxmax=60
nymax=60
nzmax=60
 
 
####### Program Control ############
#how many MC sweeps between subsequent records of states to disk
mcsweeps=100
#how many initial mcsweeps*inititer MC sweeps before recording to disk?
inititer=10
#how many records do you want on the disk iteration are there in a run?
iterations=100
 
 
#shut up if we are using cluster!!!
quiet=false
 
#what type of multiprocessing? (*none, smp, cluster, distributed, cuda, auto)
#currently only none and smp makes sense. If set to none, smp_cores defaults to 1
multiprocessing=smp
#how many cores are allowed to process in SMP? If smp_cores=0, then number of threads will corespond with number of harware processor cores.
smp_cores=4
#how many nodes in cluster?
cluster_nodes=50
#max number of processes in distributed (voluntary) environment
distributed_processes=50
#cuda options???