Trisurf Monte Carlo simulator
Samo Penic
2014-02-11 6aec63272fd6fe35a6ded508c2f2e3e19e107215
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
####### Vesicle definitions ###########
# nshell is a number of divisions of dipyramid
nshell=17
# dmax is the square of the bond length 
dmax=1.67
# bending rigidity of the membrane 
xk0=25.0
# max step size 
stepsize=0.15
 
 
#######  Cell definitions ############
nxmax=60
nymax=60
nzmax=60
 
 
####### Program Control ############
#how many iteration are there in a run?
iterations=20000
 
#shut up if we are using cluster!!!
quiet=false
 
#what type of multiprocessing? (*none, smp, cluster, distributed, cuda, auto)
#currently only none makes sense.
multiprocessing=none
#how many cores are allowed to process in SMP?
smp_cores=2
#how many nodes in cluster?
cluster_nodes=50
#max number of processes in distributed (voluntary) environment
distributed_processes=50
#cuda options???