Added direct force plugin and fixes in stretching energy

Samo Penic

2019-03-09 2c4278db6ead5c27e30a3000097ed898c968534e

1
Original written by Dan Kroll in FORTRAN. Code was then largely adapted and commented by Miha Fosnaric-Fosni. Rewritten into C by Samo Penic-Peni, with help of Miha's extensive explanations.