Trisurf Monte Carlo simulator
Samo Penic
2014-02-11 4e6285b2342038e3740ff9cea7c31364b4caa5e5
commit | author | age
d7639a 1 #include<stdio.h>
SP 2 #include<math.h>
3 #include "general.h"
4 #include "vertex.h"
a10dd5 5 #include "bond.h"
a2a676 6 #include "triangle.h"
bb77ca 7 #include "cell.h"
7958e9 8 #include "vesicle.h"
a6b1b5 9 #include "io.h"
7958e9 10 #include "initial_distribution.h"
dac2e5 11 #include "frame.h"
aec47d 12 #include "timestep.h"
d7639a 13
SP 14 /** Entrance function to the program
15   * @param argv is a number of parameters used in program call (including the program name
16   * @param argc is a pointer to strings (character arrays) which holds the arguments
17   * @returns returns 0 on success, any other number on fail.
18 */
19
20 int main(int argv, char *argc[]){
d7a113 21 ts_uint inititer,mcsweeps, iterations;
b14a8d 22 ts_vesicle *vesicle;
SP 23 /* THIS SHOULD GO INTO UNIT TEST
d7639a 24 ts_bool retval;
3131dc 25     ts_vertex_list *vlist=init_vertex_list(5);
b01cc1 26 ts_vertex_list *vlist1;
a10dd5 27 ts_bond_list *blist=init_bond_list();
a2a676 28 ts_triangle_list *tlist=init_triangle_list();
bb77ca 29 ts_cell_list *clist=init_cell_list(3,3,3,0.3);
d7639a 30
a10dd5 31 retval=vtx_add_cneighbour(blist,vlist->vtx[1],vlist->vtx[0]);
d7639a 32 if(retval==TS_FAIL) printf("1. already a member or vertex is null!\n");
a10dd5 33
e19e79 34 retval=vtx_add_neighbour(vlist->vtx[0],vlist->vtx[1]);
d7639a 35 if(retval==TS_FAIL) printf("2. already a member or vertex is null!\n");
306559 36 fprintf(stderr,"Was here");
e19e79 37 retval=vtx_remove_neighbour(vlist->vtx[1],vlist->vtx[0]);
9802f1 38 vtx_add_neighbour(vlist->vtx[0],vlist->vtx[1]);
306559 39 fprintf(stderr,"Was here too!\n");
9802f1 40
8f6a69 41 vlist->vtx[0]->x=1.0;
SP 42 vlist->vtx[0]->x=1.1;
b01cc1 43 vlist1=vertex_list_copy(vlist);
a10dd5 44 bond_add(blist, vlist->vtx[1],vlist->vtx[0]);
a2a676 45 triangle_add(tlist,vlist->vtx[1],vlist->vtx[2],vlist->vtx[3]);
a10dd5 46
a2a676 47 triangle_add(tlist,vlist->vtx[1],vlist->vtx[2],vlist->vtx[3]);
SP 48
34d3de 49 printf("Cell idx=1 has vertices=%u\n",clist->cell[0]->nvertex);
bb77ca 50 cell_add_vertex(clist->cell[0], vlist->vtx[0]);
34d3de 51 printf("Cell idx=1 has vertices=%u\n",clist->cell[0]->nvertex);
8f6a69 52 printf("Cell idx=1 has vertex[0] has x coordinate=%e\n",clist->cell[0]->vertex[0]->x);
bb77ca 53 cell_list_cell_occupation_clear(clist);
34d3de 54 printf("Cell idx=1 has vertices=%u\n",clist->cell[0]->nvertex);
bb77ca 55 cell_add_vertex(clist->cell[0], vlist->vtx[0]);
SP 56
57
a2a676 58 triangle_list_free(tlist);
a10dd5 59 bond_list_free(blist);
73f967 60 vtx_list_free(vlist);
bb77ca 61 cell_list_free(clist);
7958e9 62
b01cc1 63 vtx_list_free(vlist1);
SP 64 printf("Tests complete.\n");
b14a8d 65 */
d7a113 66 vesicle=parsetape(&mcsweeps, &inititer, &iterations);
SP 67 run_simulation(vesicle, mcsweeps, inititer, iterations);
314f2d 68
a6b1b5 69 write_master_xml_file("test.pvd");
3131dc 70 write_dout_fcompat_file(vesicle,"dout");
7958e9 71 vesicle_free(vesicle);
SP 72
d7639a 73 return 0; //program finished perfectly ok. We return 0.
SP 74